香港科技大學(科大)研究團隊在生物學 RNA 沉默機制研究中取得突破性發現,發現人類體內關鍵核酸酶DICER能精準調控微小核糖核酸(microRNAs, miRNA)的機理。這一科研突破將有助推動基因調控研究的發展,為深入了解癌症、免疫系統疾病及遺傳疾病機制提供全新角度。
這項研究由科大生命科學部副教授阮俊英教授(Tuan Anh NGUYEN)領導,並由博士生Minh Khoa NGO與Cong Truc LE共同完成,並以《DICER cleavage fidelity is governed by 5′-end binding pockets》為題撰寫論文刊登於國際級學術期刊Nature。
人類生命的訊息由DNA基因組負責編碼,並透過信使RNA(核醣核酸)傳遞與執行 DNA的遺傳訊息。RNA通常是單股,由核醣與 A(腺嘌呤)、U(尿嘧啶)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)四種核糖核苷酸組成。RNA參與許多細胞的重要功能,包括製造蛋白質、調控基因表現,甚至在某些病毒中充當遺傳物質。在RNA的世界中,DICER 核酸酶扮演關鍵的「精密剪刀」角色,它會將雙股RNA切割成極短的小片段,使這些小RNA能進入細胞的沉默系統,用來辨識並關閉錯誤或不需要的基因訊息,猶如在文章中標記與刪除錯字。
過去科學家一直聚焦研究DICER核酸酶如何實現精準切割功能。科大團隊透過前沿的生物化學與結構生物學技術,包括高通量生化實驗及冷凍電子顯微鏡技術,在原子解析度上揭示了DICER與RNA的相互作用過程。研究第一作者、博士生Minh Khoa Ngo表示:「冷凍電子顯微鏡技術讓我們在原子解析度上觀察RNA底物與DICER的結合過程,這些分子影像清晰展現了該核酸酶針對不同RNA序列做出的動態調整,從根本上改變了我們對其功能的認知。」
團隊發現DICER在切割前會進行構形調整,先把RNA引導到正確的切割位置,其後利用酵素內的結構(例如5′端結合口袋的胺基酸)精準定位,最後進入「切割就緒」的形態。
領導研究的通訊作者阮俊英教授解釋:「這就像剪刀能準確『看懂』每個字應在哪裏被切開,而又令整篇訊息保持正確。我們的研究不僅揭示了先前已知、偏好辨識尿嘧啶(U‑favoured)的5′端結合口袋,也首次發現了一個全新的、偏好辨識鳥嘌呤(G‑favoured)的5′端結合口袋。這兩個口袋共同形成了一個『雙口袋機制』(dual pocket mechanism),決定DICER在不同的位置進行切割,為闡釋DICER如何適配並切割不同RNA序列提供了全新的理論依據。」
阮教授進一步補充說:「這項發現的影響遠遠超越生物學基礎知識,不僅揭示了DICER如何整合5′端核苷酸種類、RNA結構基序(motifs),以及酵素內部結構域的動態變化以維持切割精準度,也為改良 RNA 疾病治療藥物及基因沉默技術奠定基礎,進一步為解析DICER相關遺傳疾病成因提供了新的研究方向。」
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